Индивидуальный предприниматель, перешедший на применение упрощенной системы налогообложения на основе патента, не признавался налогоплательщиком налога на добавленную стоимость, за исключением налога на добавленную стоимость, подлежащего уплате в соответствии с НК РФ при ввозе товаров на территорию Российской Федерации и иные территории, находящиеся под ее юрисдикцией, а также налога на добавленную стоимость, уплачиваемого в соответствии со ст. 174.1 НК РФ.
Об этом Письмо Минфина России от 09.04.2014 N 03-11-11/16120.
Патентная система налогообложения введена в действие с 1 января 2013 г. гл. 26.5 ''Патентная система налогообложения'' Налогового кодекса Российской Федерации (далее - Кодекс) в соответствии с Федеральным законом от 25.06.2012 N 94-ФЗ ''О внесении изменений в части первую и вторую Налогового кодекса Российской Федерации и отдельные законодательные акты Российской Федерации'' (далее - Закон N 94-ФЗ).
При этом ст. 346.25.1 Кодекса, которой регулировался порядок применения упрощенной системы налогообложения на основе патента, с 1 января 2013 г. в соответствии с Законом N 94-ФЗ утратила силу.
В соответствии с п. 3 ст. 346.11 Кодекса в редакции, действовавшей до 1 января 2013 г., индивидуальный предприниматель, перешедший на применение упрощенной системы налогообложения на основе патента, не признавался налогоплательщиком налога на добавленную стоимость, за исключением налога на добавленную стоимость, подлежащего уплате в соответствии с Кодексом при ввозе товаров на территорию Российской Федерации и иные территории, находящиеся под ее юрисдикцией, а также налога на добавленную стоимость, уплачиваемого в соответствии со ст. 174.1 Кодекса.