В случае, если медицинская и (или) образовательная организация в установленный законодательством срок подала заявление с приложением копии лицензии на применение ставки 0 процентов, но до срока сдачи налоговой декларации за первый отчетный период добровольно представила в налоговый орган заявление об уплате налога по ставке 20 процентов, то эта организация не лишается права перехода на применение нулевой ставки налога в последующие налоговые периоды, поскольку запрет на применение этой ставки, установленный п. 8 ст. 284.1 НК РФ, распространяется на организации, применявшие налоговую ставку 0 процентов в соответствии со ст. 284.1 НК РФ.
Об этом Письмо ФНС России от 05.04.2013 N ЕД-4-3/6093@.
Пунктом 1 ст. 284.1 Налогового кодекса Российской Федерации (далее - НК РФ) установлено, что организации, осуществляющие образовательную и (или) медицинскую деятельность в соответствии с законодательством Российской Федерации, вправе применять налоговую ставку 0 процентов при соблюдении условий, установленных этой статьей.
Организации, изъявившие желание применять налоговую ставку 0 процентов, не позднее чем за один месяц до начала налогового периода, начиная с которого применяется налоговая ставка 0 процентов, обязаны подать в налоговый орган заявление и копии лицензии (лицензий) на осуществление образовательной и (или) медицинской деятельности.
При этом п. 8 ст. 284.1 НК РФ предусмотрено, что организации, применявшие налоговую ставку 0 процентов в соответствии с этой статьей и перешедшие на применение налоговой ставки, установленной п. 1 ст. 284 НК РФ, в том числе в связи с несоблюдением условий, установленных п. 3 ст. 284.1 НК РФ, не вправе повторно перейти на применение налоговой ставки 0 процентов в течение пяти лет, начиная с налогового периода, в котором они перешли на применение налоговой ставки, установленной п. 1 ст. 284 НК РФ.