Так как подземные воды не относятся к общераспространенным полезным ископаемым, организация не вправе применять упрощенную систему налогообложения.
Об этом Письмо Минфина РФ от 06.12.2010 N 03-11-06/2/183.
В соответствии с пп. 8 п. 3 ст. 346.12 Налогового кодекса Российской Федерации (далее - Кодекс) не вправе применять упрощенную систему налогообложения организации и индивидуальные предприниматели, занимающиеся производством подакцизных товаров, а также добычей и реализацией полезных ископаемых, за исключением общераспространенных полезных ископаемых.
Полномочия в сфере определения перечня общераспространенных полезных ископаемых принадлежат федеральному органу государственной власти в сфере регулирования отношений недропользования, который формирует совместно с субъектами Российской Федерации региональные перечни полезных ископаемых, относимых к общераспространенным полезным ископаемым. Данная норма установлена п. 6.1 ст. 3 Закона Российской Федерации от 21.02.1992 N 2395-1 ''О недрах''.
Федеральным органом государственной власти в сфере регулирования отношений недропользования является Министерство природных ресурсов и экологии Российской Федерации (далее - Минприроды России). Перечень общераспространенных полезных ископаемых Архангельской области утвержден Распоряжением Минприроды России N 76-р, Администрации Архангельской области N 1090р от 16.11.2005 ''Об утверждении перечня общераспространенных полезных ископаемых по Архангельской области''. В указанном Перечне подземные воды не поименованы.