Организация, применяющая по разным видам деятельности два специальных налоговых режима, один из которых не освобождается от ведения бухгалтерского учета, должна вести бухгалтерский учет, составлять и представлять в налоговый орган бухгалтерскую отчетность в целом по организации.
К такому выводу пришел Минфин в письме от 20.10.2006 № 03-11-04/3/465.
Согласно п. 3 статья 4 Федерального закона от 21.11.1996 № 129-ФЗ "О бухгалтерском учете" (Закон) организации, перешедшие на упрощенную систему налогообложения, освобождаются от обязанности ведения бухгалтерского учета за исключением учета основных средств и нематериальных активов. При этом Закон не освобождает организации, осуществляющие предпринимательскую деятельность, подлежащую налогообложению единым налогом на вмененный доход для отдельных видов деятельности, от обязанности ведения бухгалтерского учета.