Минфин в письме от 05.09.2006 № 03-11-04/2/184 рассмотрел случай совмещении применения налогоплательщиком системы налогообложения единым налогом на вмененный доход (ЕНВД) и упрощенной системы налогообложения (УСН) в отношении разных видов деятельности.
Налогоплательщики, осуществляющие предпринимательскую деятельность, подлежащую налогообложению ЕНВД, и деятельность, облагаемую налогами в соответствии с иными режимами налогообложения (в том числе и УСН), должны осуществлять раздельный учет доходов от деятельности, облагаемой единым налогом, и от иных видов деятельности. Обоснованием данной позиции служит п. 7 статьи 346.26 Налогового кодекса (НК).
Минфин также рассмотрел вопрос об утрате права на применение УСН. В соответствии с п. 4 статьи 346.13 НК если по итогам отчетного (налогового) периода доходы налогоплательщика превысили 20 млн руб., то он утрачивает право на применение УСН. При этом учитываются только доходы от деятельности, облагаемой в рамках УСН.