Задолженность по пени признается безнадежной и списывается только в случае ликвидации организации.
Об этом Письмо Минфина РФ от 17.08.2007 N 03-01-03/7-93.
В соответствии с п. 1 ст. 59 Налогового кодекса Российской Федерации признается безнадежной и списывается в порядке, установленном Правительством Российской Федерации, недоимка по федеральным налогам, числящаяся за отдельными налогоплательщиками, взыскание которой оказалось невозможным в силу причин экономического, социального или юридического характера. Согласно п. 2 указанной статьи данная норма применяется также при списании безнадежной задолженности по пеням и штрафам.
В целях реализации ст. 59 Налогового кодекса Российской Федерации Правительством Российской Федерации принято Постановление от 12.02.2001 N 100 ''О порядке признания безнадежными к взысканию и списания недоимки и задолженности по пеням и штрафам по федеральным налогам и сборам, а также задолженности по страховым взносам в государственные социальные внебюджетные фонды, начисленным пеням и штрафам'', согласно которому решения о признании безнадежной к взысканию и списании недоимки и задолженности по пени и штрафам по федеральным налогам и сборам, а также задолженности по страховым взносам в государственные социальные внебюджетные фонды, числящейся за организациями по состоянию на 1 января 2001 г., начисленным пеням и штрафам принимаются в отношении ликвидированных в соответствии с законодательством Российской Федерации организаций.
Других оснований для признания задолженности по пени безнадежной и ее списания законодательством Российской Федерации о налогах и сборах не предусмотрено.