В отношении транспортно-экспедиционных услуг, оказываемых при организации и осуществлении перевозок железнодорожным транспортом от места прибытия товаров на территорию Российской Федерации (от порта или пограничных станций, расположенных на территории Российской Федерации), до станции назначения товаров, расположенной на территории Российской Федерации, применяется нулевая ставка налога на добавленную стоимость.
Об этом Письмо Минфина России от 03.07.2013 N 03-07-08/25414.
При применении налога на добавленную стоимость в отношении транспортно-экспедиционных услуг, оказываемых российской организацией, не являющейся перевозчиком на железнодорожном транспорте, при организации перевозки импортных товаров по территории Российской Федерации железнодорожным транспортом от порта прибытия товаров до станции назначения товаров в рамках договора транспортной экспедиции, сообщаем, что при решении данного вопроса следует руководствоваться нормой абз. 7 пп. 2.1 п. 1 ст. 164 Налогового кодекса Российской Федерации.
В соответствии с указанной нормой в отношении транспортно-экспедиционных услуг, оказываемых при организации и осуществлении перевозок железнодорожным транспортом от места прибытия товаров на территорию Российской Федерации (от порта или пограничных станций, расположенных на территории Российской Федерации), до станции назначения товаров, расположенной на территории Российской Федерации, применяется нулевая ставка налога на добавленную стоимость.