Если срок применения пониженной налоговой ставки начинается не с начала налогового периода, то налогоплательщик может воспользоваться правом на налогообложение части прибыли по пониженной ставке за отчетные периоды, когда он стал соответствовать установленным законом субъекта Российской Федерации условиям.
Об этом Письмо ФНС России от 26.06.2013 N ЕД-4-3/11566.
В соответствии с п. 2 ст. 286 Налогового кодекса Российской Федерации (далее - Кодекс) по итогам каждого отчетного (налогового) периода налогоплательщики исчисляют сумму авансового платежа исходя из ставки налога и прибыли, подлежащей налогообложению, рассчитанной нарастающим итогом с начала налогового периода до окончания отчетного (налогового) периода.
При этом в соответствии с п. 2 ст. 288 Кодекса для исчисления авансовых платежей и налога, подлежащих уплате в бюджет субъекта Российской Федерации по месту нахождения обособленного подразделения, налоговая база определяется исходя из доли прибыли, приходящейся на это обособленное подразделение.
Суммы авансовых платежей и налога, подлежащие зачислению в доходную часть бюджетов субъектов Российской Федерации, исчисляются по ставкам налога, действующим на территориях, где расположены организация и ее обособленные подразделения.
Возможность понижения законами субъектов Российской Федерации налоговой ставки налога на прибыль, подлежащего зачислению в бюджеты субъектов Российской Федерации, предусмотрена ст. 284 Кодекса. При установлении пониженной налоговой ставки для отдельных категорий налогоплательщиков законом могут быть установлены условия и срок ее применения.
Так, Закон Ленинградской области от 22.07.1997 N 24-ОЗ ''О государственной поддержке инвестиционной деятельности в Ленинградской области'' (далее - Закон N 24-ОЗ) устанавливает для юридических лиц, реализующих инвестиционные проекты на территории Ленинградской области, режим наибольшего благоприятствования в виде установления ставок налога на имущество организаций и налога на прибыль организаций, зачисляемого в бюджет Ленинградской области, в минимальном размере.
Если срок применения пониженной налоговой ставки начинается не с начала налогового периода, то налогоплательщик может воспользоваться правом на налогообложение части прибыли по пониженной ставке за отчетные периоды, когда он стал соответствовать установленным законом субъекта Российской Федерации условиям.
Минфин России высказал свою позицию о возможности исчисления налога по пониженной ставке с части налоговой базы за налоговый (отчетный) период в Письме от 08.06.2011 N 03-02-07/1-184.
Как следует из обращения ЗАО, в рамках подписанного им договора с Правительством Ленинградской области ЗАО как инвестор применяет пониженную налоговую ставку по налогу на прибыль в пределах срока, определенного данным договором. Начало срока применения пониженных налоговых ставок приходится на начало II квартала 2011 г.
Учитывая, что налоговая база, приходящаяся на обособленные подразделения налогоплательщика, исчисляется только по итогам отчетных или налогового периодов, в рассматриваемом случае ЗАО должно было применять полную ставку налога по отношению к налоговой базе, приходящейся на соответствующее обособленное подразделение, за отчетный период - I квартал 2011 г.
Соответственно, по пониженной налоговой ставке авансовые платежи и налог подлежали исчислению с налоговой базы, определенной как разница между налоговой базой, исчисленной за последующие отчетные и налоговый периоды, и налоговой базой за I квартал 2011 г.
В налоговой декларации, форма которой утверждена Приказом ФНС России от 15.12.2010 N ММВ-7-3/730, возможность отражения исчисления налога по разным ставкам в течение налогового периода предусмотрена только в листе 02 ( строки 130 , 170 и 200 ). В связи с этим при заполнении Приложения N 5 к листу 02 налоговой декларации за последующие (за I кварталом) отчетные периоды 2011 г. и в целом за год по обособленному подразделению ЗАО в Ленинградской области показатель строки 070 ''Сумма налога'' должен быть определен суммированием показателя этой же строки в налоговой декларации за I квартал 2011 г. и суммы налога, исчисленного по пониженной ставке с налоговой базы в указанном выше порядке.
