Суммы НДС, предъявленные поставщиками товаров, используемых налогоплательщиком для реализации товаров, приобретенных за счет средств, предоставленных из бюджета субъекта Российской Федерации, принимаются к вычету в порядке, установленном ст. ст. 173 и 172 НК РФ, и оснований для их восстановления не имеется.
Об этом Письмо Минфина России от 19.09.2013 N 03-07-11/38849.
В случае оплаты указанных товаров за счет средств, выделенных из федерального бюджета, суммы налога на добавленную стоимость вычету не подлежат, поскольку принятие к вычету (возмещению) налога, оплаченного за счет средств федерального бюджета, приведет к повторному возмещению налога из бюджета. Поэтому суммы налога на добавленную стоимость, ранее принятые к вычету по таким товарам (работам, услугам), следует восстановить на основании пп. 6 п. 3 ст. 170 Налогового кодекса Российской Федерации (далее - Кодекс).
Что касается применения вычетов по налогу на добавленную стоимость по товарам, приобретенным за счет средств, предоставленных из бюджета субъекта Российской Федерации, то в этом случае указанные суммы налога, предъявленные поставщиками товаров, используемых налогоплательщиком для реализации товаров, принимаются к вычету в порядке, установленном ст. ст. 173 и 172 Кодекса, и оснований для их восстановления не имеется.