В случае, если индивидуальный предприниматель, применяющий упрощенную систему налогообложения, не выставляет покупателям счета-фактуры с выделением суммы НДС, но при этом является налоговым агентом по НДС, то он вправе на основании положений абз. 2 п. 5 ст. 174 НК РФ представить в налоговый орган налоговую декларацию по НДС на бумажном носителе.
Об этом Письмо ФНС России от 26.02.2014 N ГД-3-3/780@.
Согласно абз. 1 п. 5 ст. 174 Налогового кодекса Российской Федерации (далее - Кодекс) в редакции Федерального закона от 28.06.2013 N 134-ФЗ начиная с 1 января 2014 г. налогоплательщики (в том числе являющиеся налоговыми агентами), а также лица, указанные в п. 5 ст. 173 Кодекса, обязаны представить в налоговые органы по месту своего учета соответствующую налоговую декларацию по установленному формату в электронной форме по телекоммуникационным каналам связи через оператора электронного документооборота.
Учитывая изложенное, в случае выставления индивидуальным предпринимателем, применяющим упрощенную систему налогообложения, счета-фактуры с выделением суммы НДС указанный индивидуальный предприниматель обязан представить в налоговый орган по месту своего учета налоговую декларацию по НДС в электронной форме в порядке, предусмотренном вышеуказанной нормой Кодекса.
Вместе с тем абз. 2 п. 5 ст. 174 Кодекса предусмотрено, что налоговые агенты, не являющиеся налогоплательщиками НДС, обязаны представить в налоговые органы по месту своего учета соответствующую налоговую декларацию в срок не позднее 20-го числа месяца, следующего за истекшим налоговым периодом.