На основании пп. 2 п. 3 ст. 170 НК РФ суммы налога на добавленную стоимость, принятые к вычету налогоплательщиком по объектам недвижимости, введенным в эксплуатацию в 1998 г., подлежат восстановлению при дальнейшем использовании основных средств для осуществления операций, не облагаемых налогом на добавленную стоимость, в размере суммы, пропорциональной остаточной (балансовой) стоимости без учета переоценки.
Об этом Письмо Минфина России от 01.04.2014 N 03-07-РЗ/14415.
Порядок восстановления принятых к вычету сумм налога на добавленную стоимость по объектам недвижимости, предусмотренный п. 6 ст. 171 Налогового кодекса Российской Федерации (далее - Кодекс), установлен Федеральным законом от 22.07.2005 N 119-ФЗ ''О внесении изменений в главу 21 части второй Налогового кодекса Российской Федерации и о признании утратившими силу отдельных положений актов законодательства Российской Федерации о налогах и сборах'' и на основании п. 2 ст. 3 этого Федерального закона вступил в силу с 01.01.2006. В связи с этим указанный порядок применяется в отношении объектов недвижимости, по которым начисление амортизации в соответствии с абз. 2 п. 2 ст. 259 Кодекса производилось начиная с 01.01.2006.
Что касается объектов недвижимости, введенных в эксплуатацию в 1998 г., то на основании пп. 2 п. 3 ст. 170 Кодекса суммы налога на добавленную стоимость, принятые к вычету налогоплательщиком по этим объектам, подлежат восстановлению при дальнейшем использовании основных средств для осуществления операций, не облагаемых налогом на добавленную стоимость, в размере суммы, пропорциональной остаточной (балансовой) стоимости без учета переоценки.