Депозитарий, выполняя функции налогового агента, должен исчислить и удержать налог на доходы физических лиц при выплате доходов независимо от того, перечисляются ли денежные средства, поступившие на специальный счет депозитария, на банковский счет клиента или по его распоряжению на специальный брокерский счет налогового агента.
Об этом Письмо Минфина России от 18.04.2014 N 03-04-06/18016.
В соответствии с пп. 5 п. 2 ст. 226.1 Налогового кодекса Российской Федерации (далее - Кодекс) при осуществлении операций с ценными бумагами и операций с финансовыми инструментами срочных сделок налоговым агентом признается депозитарий, осуществляющий выплату налогоплательщику дохода по ценным бумагам, выпущенным российскими организациями, права по которым учитываются в таком депозитарии на дату, определенную в решении о выплате (об объявлении) дохода, на счете депо владельца этих ценных бумаг, в том числе торговом счете депо владельца.
Профессиональный участник рынка ценных бумаг может осуществлять одновременно как депозитарную, так и брокерскую деятельность. В рамках депозитарной деятельности депозитарий открывает специальный депозитарный счет в банке для учета денежных средств депонентов, в том числе для зачисления доходов по операциям с ценными бумагами физических лиц, заключивших договоры с депозитарием, и специальный брокерский счет в рамках брокерской деятельности. При этом денежные средства клиентов со счета депозитария могут перечисляться на специальный брокерский счет для совершения операций в рамках договора на брокерское обслуживание клиентов.
В соответствии с абз. 5 п. 7 ст. 226.1 Кодекса исчисление и уплата суммы налога в отношении доходов по ценным бумагам производятся налоговым агентом при осуществлении выплат такого дохода в пользу физического лица.
Согласно абз. 2 п. 10 ст. 226.1 Кодекса под выплатой денежных средств в целях данной статьи понимается выплата налоговым агентом наличных денежных средств налогоплательщику или третьему лицу по требованию налогоплательщика, а также перечисление денежных средств на банковский счет налогоплательщика или на счет третьего лица по требованию налогоплательщика.