Согласно пп. 16 п. 3 ст. 149 Налогового кодекса Российской Федерации (далее - Кодекс), научно-исследовательские и опытно-конструкторские работы, выполняемые за счет средств бюджетов как исполнителями, так и соисполнителями, налогом на добавленную стоимость не облагаются. При этом следует отметить, что согласно п. 5 ст. 149 Кодекса налогоплательщики, осуществляющие указанные операции, вправе отказаться от освобождения, представив соответствующее заявление в налоговый орган.
Об этом - Письмо Минфина РФ от 26.07.2007 N 03-07-07/25
Что касается строительно-монтажных, проектных и других работ, не являющихся научно-исследовательскими и опытно-конструкторскими и выполняемых соисполнителями научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ, то норма вышеуказанного пп. 16 п. 3 ст. 149 Кодекса на такие работы не распространяется.