В соответствии с п. 2 ст. 346.11 НК РФ организации, применяющие упрощенную систему налогообложения, не признаются налогоплательщиками налога на добавленную стоимость, за исключением налога на добавленную стоимость, подлежащего уплате в соответствии с Налоговым кодексом РФ при ввозе товаров на таможенную территорию Российской Федерации, сообщает сайт taxin.ru (http://taxin.ru/docs/A99C3AF40323B702C32573EF000B5C25.html)
Пунктом 3 ст. 169 НК РФ предусмотрено, что составлять счета-фактуры обязаны налогоплательщики налога на добавленную стоимость, реализующие товары (работы, услуги) на территории Российской Федерации. В связи с этим организации, применяющие упрощенную систему налогообложения, при осуществлении операций по реализации товаров (работ, услуг) оформлять счета-фактуры не должны.
В подпункте 1 пункта 5 статьи 173 НК РФ указывается, что в случае выставления покупателю счета-фактуры с выделением суммы налога на добавленную стоимость лицами, не являющимися налогоплательщиками, сумма налога на добавленную стоимость, подлежащая уплате в бюджет, определяется как сумма налога, указанная в соответствующем счете-фактуре, переданном покупателю товаров (работ, услуг).
В связи с тем, что налогоплательщики, применяющие упрощенную систему налогообложения, не признаются налогоплательщиками налога на добавленную стоимость, в случае выставления счетов-фактур покупателям товаров (работ, услуг) указанные налогоплательщики обязаны руководствоваться положениями пп. 1 п. 5 ст. 173 НК РФ.
На основании п. 5 ст. 173 и п. 5 ст. 174 НК РФ организации, не признаваемые налогоплательщиками налога на добавленную стоимость в связи с применением упрощенной системы налогообложения и выставившие при реализации товаров (работ, услуг, имущественных прав) покупателям счета-фактуры с выделенной суммой налога на добавленную стоимость, обязаны исчислить, уплатить в бюджет налог на добавленную стоимость и представить в налоговые органы по месту своего учета соответствующую налоговую декларацию по данному налогу. При этом вычет налога на добавленную стоимость по приобретенным товарам (работам, услугам) нормами главы 21 "Налог на добавленную стоимость" Налогового кодекса не предусмотрен.