При соблюдении условий, предусмотренных гл. 26.2 НК РФ, хозяйственные общества независимо от состава и количества учредителей, а также размера их доли вправе с 1 января 2011 г. применять упрощенную систему налогообложения.
Об этом Письмо ФНС РФ от 11.10.2011 N ЕД-4-3/16719@.
В соответствии с пп. 14 п. 3 ст. 346.12 Налогового кодекса Российской Федерации (далее - Кодекс) не вправе применять упрощенную систему налогообложения организации, в которых доля участия других организаций составляет более 25 процентов.
Федеральным законом от 27.11.2010 N 310-ФЗ ''О внесении изменения в статью 346.12 части второй Налогового кодекса Российской Федерации'' (далее - Федеральный закон N 310-ФЗ) внесены изменения в вышеуказанный подпункт п. 3 ст. 346.12 Кодекса, в соответствии с которыми данное ограничение не распространяется, в частности, на учрежденные в соответствии с Федеральным законом от 22.08.1996 N 125-ФЗ ''О высшем и послевузовском профессиональном образовании'' высшими учебными заведениями, являющимися бюджетными образовательными учреждениями, и созданными государственными академиями наук высшими учебными заведениями хозяйственные общества, деятельность которых заключается в практическом применении (внедрении) результатов интеллектуальной деятельности (программ для электронных вычислительных машин, баз данных, изобретений, полезных моделей, промышленных образцов, селекционных достижений, топологий интегральных микросхем, секретов производства (ноу-хау)), исключительные права на которые принадлежат данным высшим учебным заведениям.
Данные изменения вступили в силу с 1 января 2011 г.
При этом п. 8 ст. 27 Федерального закона от 22.08.1996 N 125-ФЗ предусмотрено, что высшие учебные заведения, являющиеся бюджетными образовательными учреждениями, и созданные государственными академиями наук высшие учебные заведения имеют право быть учредителями (в том числе совместно с другими лицами) хозяйственных обществ.
Вместе с тем ограничений по составу и количеству учредителей, а также размеру доли учредителей у вышеуказанных хозяйственных обществ Федеральным законом N 310-ФЗ и Кодексом не установлено.