Если участник проекта воспользовался правом ведения Книги учета доходов и расходов, он не подает в налоговый орган бухгалтерскую отчетность, которая представляет собой единую систему данных об имущественном и финансовом положении организации и о результатах ее хозяйственной деятельности, составляемую на основе данных бухгалтерского учета по установленным формам ( ст. 2 Закона N 129-ФЗ).
Об этом Письмо УФНС России по г. Москве от 20.01.2012 N 16-15/004428@.
Пунктом 4 ст. 4 Федерального закона от 21.11.1996 N 129-ФЗ (далее - Закон N 129-ФЗ) предусмотрено, что организации, получившие статус участников проекта по осуществлению исследований, разработок и коммерциализации их результатов в соответствии с Федеральным законом ''Об инновационном центре ''Сколково'', в случае непревышения годового объема их выручки от реализации товаров (работ, услуг) в размере 1 млрд руб. вправе вести учет доходов и расходов в порядке, установленном гл. 26.2 Налогового кодекса РФ, если иное не предусмотрено названным пунктом.
Организации, использующие право, предусмотренное абз. 1 названного пункта , освобождаются от обязанности ведения бухгалтерского учета.
Таким образом, участники проекта ''Сколково'' вправе по своему усмотрению вести бухгалтерский учет либо учет доходов и расходов в порядке, предусмотренном гл. 26.2 НК РФ.
Между тем учет основных средств и нематериальных активов ведется в порядке, предусмотренном законодательством Российской Федерации о бухгалтерском учете.
Организации - участники проекта ''Сколково'' обязаны вести бухгалтерский учет в соответствии с законодательством Российской Федерации начиная с начала календарного года, следующего за годом, в котором годовой объем выручки от реализации товаров (работ, услуг) этих организаций превысил 1 млрд руб.
При этом п. 5.1 ст. 284 Налогового кодекса РФ также предусмотрено, что участники проекта ведут налоговый учет в порядке, установленном ст. 346.24 НК РФ, в случаях, если они воспользовались правом ведения Книги учета доходов и расходов в соответствии с п. 4 ст. 4 Закона N 129-ФЗ.