При возврате товаров, принятых покупателем на учет, счет-фактура по возвращаемым товарам выставляется покупателем.
Об этом Письмо Минфина России от 28.08.2012 N 03-07-09/126.
Подпунктом ''а'' п. 7 Правил ведения журнала учета полученных и выставленных счетов-фактур, применяемых при расчетах по налогу на добавленную стоимость, утвержденных Постановлением Правительства Российской Федерации от 26.12.2011 N 1137 (далее - Постановление), установлена обязанность покупателя отражать в ч. 1 ''Выставленные счета-фактуры'' журнала учета показатели счетов-фактур, выставленных покупателем продавцу при возврате продавцу принятых покупателем на учет товаров.
Таким образом, при возврате товаров, принятых покупателем на учет, счет-фактура по возвращаемым товарам выставляется покупателем.