Налоговая база по НДС при реализации налогоплательщиком товаров (работ, услуг) определяется как стоимость этих товаров (работ, услуг), исчисленная исходя из цен, определяемых в соответствии со ст. 105.3 НК РФ, с учетом акцизов (для подакцизных товаров) и без включения в них налога. Исключений из указанного порядка для индивидуальных предпринимателей, являющихся налогоплательщиками налога на добавленную стоимость, не установлено.
Об этом Письмо Минфина России от 21.09.2012 N 03-07-14/95.
В соответствии со ст. 146 Налогового кодекса Российской Федерации (далее - Кодекс) объектом налогообложения налогом на добавленную стоимость признаются операции по реализации товаров (работ, услуг) на территории Российской Федерации.
Согласно п. 1 ст. 154 Кодекса налоговая база по налогу на добавленную стоимость при реализации налогоплательщиком товаров (работ, услуг) определяется как стоимость этих товаров (работ, услуг), исчисленная исходя из цен, определяемых в соответствии со ст. 105.3 Кодекса, с учетом акцизов (для подакцизных товаров) и без включения в них налога. Исключений из указанного порядка для индивидуальных предпринимателей, являющихся налогоплательщиками налога на добавленную стоимость, не установлено.
Таким образом, при продаже нежилого помещения налог на добавленную стоимость исчисляется со всей стоимости этого помещения.