Если за 2012 г. средняя численность работников организации превышает 100 человек (по всем видам предпринимательской деятельности), то такая организация не вправе перейти с 1 января 2013 г. на уплату единого налога на вмененный доход.
Об этом Письмо Минфина России от 29.12.2012 N 03-11-06/3/91.
В соответствии с пп. 1 п. 2.2 ст. 346.26 Налогового кодекса Российской Федерации (далее - Кодекс) на уплату единого налога на вмененный доход для отдельных видов деятельности не переводятся, в частности, организации и индивидуальные предприниматели, среднесписочная численность работников которых за предшествующий календарный год, определяемая в порядке, устанавливаемом федеральным органом исполнительной власти, уполномоченным в области статистики, превышает 100 человек.
В соответствии с Федеральным законом от 25.06.2012 N 94-ФЗ ''О внесении изменений в части первую и вторую Налогового кодекса Российской Федерации и отдельные законодательные акты Российской Федерации'' (далее - Закон N 94-ФЗ) с 1 января 2013 г. вступают в силу изменения в гл. 26.3 ''Система налогообложения в виде единого налога на вмененный доход для отдельных видов деятельности'' Кодекса.
Так, пп. 1 п. 2.2 ст. 346.26 Кодекса (в ред. Закона N 94-ФЗ) установлено, что на уплату единого налога на вмененный доход не вправе переходить организации и индивидуальные предприниматели, средняя численность работников которых за предшествующий календарный год, определяемая в порядке, устанавливаемом федеральным органом исполнительной власти, уполномоченным в области статистики, превышает 100 человек.
Согласно действующему порядку, в соответствии с абз. 2 п. 2.3 ст. 346.26 Кодекса, если налогоплательщик, утративший право на применение системы налогообложения, установленной гл. 26.3 Кодекса, осуществляет виды предпринимательской деятельности, переведенные решениями представительных органов муниципальных районов, городских округов, законодательных (представительных) органов государственной власти городов федерального значения Москвы и Санкт-Петербурга на уплату единого налога на вмененный доход, без нарушения требований, установленных пп. 1 и 2 п. 2.2 ст. 346.26 Кодекса, то он обязан перейти на систему налогообложения, установленную гл. 26.3 Кодекса, с начала следующего налогового периода по единому налогу на вмененный доход, то есть с начала квартала, следующего за кварталом, в котором налогоплательщиком устранены несоответствия установленным требованиям.
В соответствии с пп. ''в'' п. 20 ст. 2 и п. 1 ст. 9 Закона N 94-ФЗ абз. 2 п. 2.3 ст. 346.26 Кодекса утрачивает силу с 1 января 2013 г.
Поэтому налогоплательщик единого налога на вмененный доход, утративший в каком-либо из налоговых периодов (кварталов) 2012 г. право применять данную систему налогообложения в связи с превышением ограничения по среднесписочной численности работников, установленного пп. 1 п. 2.2 ст. 346.26 Кодекса, вправе перейти на уплату единого налога на вмененный доход с 1 января 2013 г., если средняя численность его работников за 2012 г. не превышает 100 человек, а также при условии соблюдения иных ограничений, установленных гл. 26.3 Кодекса.