Не включаются в налоговую базу по НДС денежные средства, полученные налогоплательщиком после перехода с упрощенной системы на общий режим налогообложения за товары, реализованные в период применения упрощенной системы налогообложения. Указанная сумма дохода в налоговой декларации по НДС не отражается.
Об этом Письмо УФНС РФ по г. Москве от 22.08.2008 N 19-11/079041.
Согласно п. 2 ст. 346.11 НК РФ организации, применяющие упрощенную систему, не признаются плательщиками НДС, за исключением НДС, подлежащего уплате в соответствии с НК РФ при ввозе товаров на таможенную территорию РФ, а также НДС, уплачиваемого на основании ст. 174.1 НК РФ.
Следовательно, у организаций, применяющих упрощенную систему, не возникает обязанности по составлению счетов-фактур, ведению книг покупок, книг продаж и представлению налоговой декларации.