Суммы НДС подлежат возмещению (зачету) налогоплательщику за исключением случаев, когда налоговая декларация подана налогоплательщиком по истечении трех лет после окончания соответствующего налогового периода.
Об этом Письмо Минфина РФ от 16.01.2009 N 03-07-11/09.
Согласно п. 1 ст. 172 Налогового кодекса Российской Федерации (далее - Кодекс) вычеты налога на добавленную стоимость производятся на основании счетов-фактур, выставленных продавцами товаров (работ, услуг) после их принятия на учет и при наличии у налогоплательщика соответствующих первичных документов.
Пунктом 2 ст. 173 Кодекса установлено, что суммы налога на добавленную стоимость подлежат возмещению (зачету) налогоплательщику в порядке и на условиях, которые предусмотрены ст. 176 Кодекса, за исключением случаев, когда налоговая декларация подана налогоплательщиком по истечении трех лет после окончания соответствующего налогового периода. При этом зачет налога в разных налоговых периодах, то есть по частям от сумм налога, указанных в счетах-фактурах, не предусмотрен.