В случае продажи налогоплательщиком ценных бумаг реорганизуемой организации до их конвертации в ценные бумаги вновь созданной организации применяется общий порядок налогообложения, установленный ст. 214.1 НК РФ. При этом фактически произведенные и документально подтвержденные расходы на приобретение, реализацию и хранение указанных ценных бумаг учитываются в полном объеме.
Об этом Письмо Минфина РФ от 13.02.2009 N 03-04-06-01/29.
Особенности определения налоговой базы, исчисления и уплаты налога на доходы физических лиц по операциям с ценными бумагами и операциям с финансовыми инструментами срочных сделок, базисным активом по которым являются ценные бумаги или фондовые индексы, рассчитываемые организаторами торговли на рынке ценных бумаг, установлены ст. 214.1 Налогового кодекса Российской Федерации (далее - Кодекс).
Пунктом 3 ст. 214.1 Кодекса предусмотрено определение доходов от операций купли-продажи ценных бумаг как разницы между суммами доходов, полученных от реализации ценных бумаг, и документально подтвержденными расходами на приобретение, реализацию и хранение ценных бумаг, фактически произведенными налогоплательщиком.
При этом специальный порядок исчисления налога установлен ст. 214.1 Кодекса только в отношении реализации ценных бумаг, полученных налогоплательщиком при реорганизации организаций.