Организация-плательщик признается налоговым агентом по отношению к физическому лицу - наймодателю и обязана исчислить, удержать и перечислить в бюджет соответствующую сумму налога на доходы физических лиц.
Об этом Письмо Минфина РФ от 07.04.2009 N 03-04-06-01/83.
В соответствии с п. 1 ст. 210 Налогового кодекса Российской Федерации (далее - Кодекс) при определении налоговой базы по налогу на доходы физических лиц учитываются все доходы налогоплательщика, полученные им как в денежной, так и в натуральной формах, или право на распоряжение которыми у него возникло, а также доходы в виде материальной выгоды, определяемой в соответствии со ст. 212 Кодекса.
В соответствии со ст. 226 Кодекса организации, от которых или в результате отношений с которыми налогоплательщик получил доходы, указанные в п. 2 ст. 226 Кодекса, обязаны исчислить, удержать у налогоплательщика и уплатить сумму налога на доходы физических лиц в соответствующий бюджет.
Исчисление сумм и уплата налога в соответствии с данной статьей производятся в отношении всех доходов налогоплательщика, источником которых является налоговый агент, за исключением доходов, в отношении которых исчисление и уплата налога осуществляются в соответствии со ст. ст. 214.1 , 227 и 228 Кодекса с зачетом ранее удержанных сумм налога.
При этом доходы в виде сумм арендной платы, полученные физическим лицом - наймодателем (не являющимся индивидуальным предпринимателем) по договору найма от организации, являющейся источником выплаты таких доходов, в перечнях, установленных вышеуказанными статьями, не поименованы.
При этом если оплата найма жилого помещения производится за счет средств организации-плательщика, то на основании ст. 211 Кодекса у физического лица - нанимателя возникает доход в натуральной форме.