Суммы налога на добавленную стоимость, ранее принятые к вычету по товарам (в том числе семян, удобрений, горюче-смазочных материалов), расходы по которым частично компенсированы из федерального бюджета, следует восстановить.
Об этом Письмо Минфина РФ от 31.08.2009 N 03-07-14/91.
На основании п. 1 ст. 172 гл. 21 ''Налог на добавленную стоимость'' Налогового кодекса Российской Федерации вычетам подлежат суммы налога, предъявленные налогоплательщику при приобретении товаров (работ, услуг) на территории Российской Федерации, после принятия на учет указанных товаров (работ, услуг) и при наличии соответствующих первичных документов.
В случае приобретения товаров (в том числе семян, удобрений, горюче-смазочных материалов) за счет средств федерального бюджета суммы налога на добавленную стоимость оплачиваются продавцам данных товаров за счет этих средств. Поэтому предъявление к вычету (возмещению из бюджета) указанных сумм, по нашему мнению, неправомерно.