В случае если при заполнении полной таможенной декларации требуется корректировка в меньшую сторону суммы таможенной пошлины, то организации следует внести изменения в налоговую декларацию по налогу на прибыль за отчетный (налоговый) период, в котором дополнительно исчисленные суммы таможенных пошлин были учтены. Сумма возвращенной экспортной пошлины должна уменьшать расходы того периода, когда была подана временная таможенная декларация.
Об этом Письмо Минфина РФ от 07.10.2009 N 03-03-06/1/650.
Согласно пп. 1 п. 1 ст. 264 Налогового кодекса Российской Федерации (далее - Кодекс) суммы налогов и сборов, таможенных пошлин и сборов, начисленные в установленном законодательством Российской Федерации порядке, за исключением перечисленных в ст. 270 Кодекса, относятся к прочим расходам, связанным с производством и реализацией.
Таким образом, суммы экспортных таможенных пошлин, начисленные и отраженные во временной таможенной декларации, учитываются в составе прочих расходов на дату составления временной таможенной декларации ( ст. 272 Кодекса).
Согласно ст. 81 Кодекса при обнаружении налогоплательщиком в поданной им в налоговый орган налоговой декларации факта неотражения или неполноты отражения сведений, а также ошибок, приводящих к занижению суммы налога, подлежащей уплате, налогоплательщик обязан внести необходимые изменения в налоговую декларацию и представить в налоговый орган уточненную налоговую декларацию в порядке, установленном данной статьей.