В случае, если организация обратилась в уполномоченный орган за предоставлением лицензии до 29 января 2010 г., уплатив государственную пошлину за рассмотрение заявления о предоставлении лицензии и государственную пошлину за предоставление лицензии, а уполномоченный орган, рассмотрев заявление, принял решение о предоставлении лицензии после указанной даты, то государственная пошлина за совершение данных юридически значимых действий должна уплачиваться в размерах, действовавших до 29 января 2010 г.
Об этом Письмо Минфина РФ от 03.03.2010 N 03-05-04-03/13.
Статьей 333.16 Налогового кодекса Российской Федерации (далее - НК РФ) установлено, что государственная пошлина является сбором, взимаемым с физических лиц и организаций при их обращении в государственные органы, органы местного самоуправления, иные органы и (или) к должностным лицам, которые уполномочены в соответствии с законодательными актами Российской Федерации, законодательными актами субъектов Российской Федерации и нормативными правовыми актами органов местного самоуправления, за совершением в отношении этих лиц юридически значимых действий, предусмотренных гл. 25.3 НК РФ, за исключением действий, совершаемых консульскими учреждениями Российской Федерации.
В связи с этим размер государственной пошлины определяется в соответствии с гл. 25.3 ''Государственная пошлина'' НК РФ при обращении граждан и организаций в государственные органы, органы местного самоуправления, иные уполномоченные органы и (или) к должностным лицам.
Согласно пп. 6 п. 1 ст. 333.18 НК РФ плательщики уплачивают государственную пошлину, если не установлено иное, до подачи заявлений и (или) иных документов на совершение юридически значимых действий.
В случае если организация обратилась в уполномоченный орган за предоставлением лицензии до 29 января 2010 г. и уплатила государственную пошлину за рассмотрение заявления о предоставлении лицензии, а уполномоченный орган принял решение о предоставлении лицензии после указанной даты, то начиная с 29 января 2010 г. государственная пошлина за предоставление лицензии должна уплачиваться в размерах, установленных пп. 92 п. 1 ст. 333.33 НК РФ (в ред. Закона N 374-ФЗ).