При продаже налоговым агентом по поручению налогоплательщика ценных бумаг налоговый агент обязан исчислить, удержать у налогоплательщика и перечислить в бюджет сумму налога на доходы физических лиц. При этом налоговая база рассчитывается налоговым агентом с учетом расходов, указанных в п. 10 ст. 214.1 НК РФ, за исключением расходов, которые были осуществлены налогоплательщиком самостоятельно без участия налогового агента.
Об этом Письмо Минфина РФ от 13.12.2010 N 03-04-05/2-722.
Особенности определения налоговой базы, исчисления и уплаты налога на доходы физических лиц по операциям с ценными бумагами и операциям с финансовыми инструментами срочных сделок установлены ст. 214.1 Налогового кодекса Российской Федерации (далее - Кодекс).
В соответствии со ст. 214.1 Кодекса налоговым агентом признается доверительный управляющий, брокер, лицо, осуществляющее операции по договору поручения, договору комиссии, агентскому договору в пользу налогоплательщика, иное лицо, признаваемое налоговым агентом в соответствии с Кодексом.
Таким образом, в тех случаях, когда организация выступает в качестве одного из вышеуказанных лиц, она является налоговым агентом и обязана исчислять, удерживать у налогоплательщика и перечислять в бюджет сумму налога на доходы физических лиц.
Пунктом 12 ст. 214.1 Кодекса установлено, что финансовый результат по операциям с ценными бумагами и по операциям с финансовыми инструментами срочных сделок определяется как доходы от операций за вычетом соответствующих расходов, указанных в п. 10 ст. 214.1 Кодекса.
Вместе с этим абз. 2 п. 18 ст. 214.1 Кодекса установлено, что налоговый агент определяет налоговую базу налогоплательщика по всем видам доходов от операций, осуществляемых налоговым агентом в пользу налогоплательщика.
Из этого следует, что организация в качестве налогового агента не может учитывать расходы физического лица, произведенные им без участия данной организации.
Такие расходы могут быть учтены физическим лицом самостоятельно при подаче налоговой декларации в налоговый орган по окончании налогового периода.